bioRxiv preprint Score 70

ORIGAMI框架揭示协同转录调控与疾病重连

深度学习模型整合多组学数据,构建功能性基因调控网络,揭示疾病相关调控变化。

基因调控由分散的顺式调控元件协调作用实现,但整合成功能网络的过程尚不清晰。ORIGAMI作为多组学深度学习框架,基于转录输出约束重建功能性顺式调控网络。该模型将调控建模为潜在图推断任务,整合DNA序列、表观基因组信号和三维染色质先验,推断功能交互而非仅结构邻近。研究显示,ORIGAMI能准确捕获协同调控并识别疾病相关重连,为理解基因调控机制提供新工具。注意:本研究为预印本,未经同行评审。

gene regulationdeep learningcis-regulatory networks