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通用表观遗传时钟揭示癌细胞年龄相关脆弱性

新开发GepiClock在肿瘤中准确预测年龄,发现年轻癌细胞对WEE1抑制更敏感,年老者依赖PRC2。

表观遗传时钟通常难以在癌症中应用,因为癌细胞经历了广泛的表观遗传重编程。近日,研究人员开发了GepiClock,这是一种基于癌症基因组图谱中32种癌症类型的4862个CpG位点训练的时钟,能在肿瘤和正常样本中准确预测年龄,表明核心衰老相关甲基化程序在恶性转化后仍可检测。将该时钟应用于分子特征明确的癌细胞系,并结合药物反应和CRISPR筛选数据,揭示了年龄相关的治疗脆弱性:预测年龄越年轻的细胞对WEE1抑制越敏感,而预测年龄越年老的细胞则依赖于多梳抑制复合物2(PRC2),后者可作为一种潜在的治疗靶点。该研究为理解癌症中的细胞衰老和治疗策略提供了新视角。注:该研究为预印本,尚未经过同行评审。

epigeneticscanceragingtherapeutic vulnerabilities