缺氧内皮细胞的全基因组顺反组图谱

缺氧应激主要通过缺氧诱导因子（HIF）结合基因调控区域的缺氧反应元件（HRE）来触发转录信号。然而，已知的HRE中仅有约1%在缺氧期间被HIF占据，提示有其他缺氧反应因子的参与。为了解决这一问题，研究人员采用了MNase定义的顺反组占有率分析测序（MOA-seq），该技术基于MNase酶切，能够全基因组范围内检测转录因子等反式调控因子与顺式元件的结合。通过对人类脐静脉内皮细胞（HUVEC）进行分析，研究揭示了缺氧条件下的顺反组响应图谱。结果表明，除了HIF外，还有其他转录因子在缺氧反应中发挥重要作用。研究鉴定了数千个新的缺氧响应结合位点，这些位点不依赖于经典的HRE序列。该发现拓展了对缺氧基因调控机制的理解，并为相关疾病治疗提供了潜在靶点。需要注意的是，本研究为预印本，尚未经过同行评审。