TrIdent：自动化病毒样颗粒DNA转移分析新工具

转导是细菌通过病毒样颗粒（VLP）进行水平基因转移的一种方式。转导组学通过测序分析VLP携带的DNA，但传统分析需手工检查覆盖模式，耗时且难以处理多样本。近日，研究人员开发了R包TrIdent，利用模式匹配算法自动识别转导事件。该方法将VLP测序读段映射至宏基因组重叠群，自动化分类覆盖模式，显著减少人工干预。该工具已在模拟和真实数据集上验证，准确率高，为大规模转导组学研究提供了高效方案。注意：本研究为预印本，尚未经过同行评审。