噪声模板扩散模型突破抗体设计瓶颈

抗体设计面临抗原-抗体复合物数据稀缺的困境，而互补决定区（CDR）的序列与构象空间极其庞大。传统方法依赖数据库模板作为硬条件，但对于新抗原，模板往往稀疏且有偏差，容易导致负迁移。近日，预印本研究提出“鲁棒条件扩散模型”，创新性地将检索到的噪声模板作为软条件，引导扩散过程生成抗体CDR的序列和结构。该模型在多个抗原测试中展现出更高的结合能评分和序列多样性，尤其在模板质量较差时优势更明显。作者强调，该方法为抗体药物研发提供了更具鲁棒性的设计工具，但尚需实验验证。