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ATAClone:从scATAC-seq识别癌症克隆

新方法ATAClone可直接从单细胞ATAC-seq数据识别癌细胞克隆并估计拷贝数变异。

单细胞ATAC-seq(scATAC-seq)技术广泛应用于癌症异质性研究,但传统的无监督聚类常受DNA拷贝数变异影响。新开发的ATAClone方法可直接从数据中识别具有相似拷贝数谱的癌细胞克隆,并同时估计其拷贝数。该方法适用于独立的scATAC-seq和multiome数据,并通过模拟自动确定最佳聚类分辨率,避免人工选择偏差。目前该研究为预印本,尚未经同行评审。

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