广义Chargaff对称性在密码子使用中普遍存在
研究揭示密码子使用中隐藏的反向互补对称性,为理解进化约束提供新视角。
密码子使用偏好记录了突变、选择、漂变和翻译限制等信息,但通常与广义Chargaff对称性分开考虑。后者指DNA长序列中词及其反向互补序列出现频率相近的倾向。一项预印本研究系统考察了密码子使用是否包含可测量的反向互补成分,并量化了偏离程度。研究者首先避免预设反向互补对称性,而是穷举评估了64个密码子的所有非平凡符号对合。这些对合由自逆核苷酸图谱和自逆密码子位置置换构成。结果显示,不同物种的密码子使用中普遍存在广义Chargaff对称性成分,且偏离程度可量化。该发现提示密码子使用的进化约束可能被低估。注:该研究尚未经过同行评审。