EpiLink模型:无标签数据也能精准追踪传播链
新模型利用模拟数据训练,无需真实传播标记,即可在暴发中识别直接感染链接。
在传染病监测中,从病原体基因组序列识别近期传播链至关重要,但传统方法依赖固定遗传距离阈值,在快速暴发中容易混淆直接传播与非传播的近缘感染。EpiLink通过模拟进化过程生成标记训练数据,无需真实传播标签即可训练监督模型,显著提升区分准确性。该预印本研究展示了在模拟暴发数据集上的优越性能,为实时基因组流行病学提供了新工具。
新模型利用模拟数据训练,无需真实传播标记,即可在暴发中识别直接感染链接。
在传染病监测中,从病原体基因组序列识别近期传播链至关重要,但传统方法依赖固定遗传距离阈值,在快速暴发中容易混淆直接传播与非传播的近缘感染。EpiLink通过模拟进化过程生成标记训练数据,无需真实传播标签即可训练监督模型,显著提升区分准确性。该预印本研究展示了在模拟暴发数据集上的优越性能,为实时基因组流行病学提供了新工具。