VeSpA:自动化血管分析的新工具
开源QuPath扩展VeSpA实现CD31染色全切片图像的自动血管分割与形态测量。
血管结构的定量分析对于研究组织微环境、肿瘤生物学及血管重塑至关重要。然而,传统方法常依赖手动操作或编程技能,缺乏与数字病理平台的整合。近日,研究人员开发了VeSpA(Vessel Spatial Analysis),一个开源的QuPath扩展工具,可自动化处理CD31染色的全切片图像,实现血管分割、形态测量和空间分析。
VeSpA通过可配置的信号提取(默认使用CMYK黄色通道,可选DAB)进行血管检测,并生成形态参数和空间分布数据。该工具无需编程知识,且与QuPath无缝集成,支持批量处理和结果可视化。
VeSpA的发布将极大便利病理学家和生物学家对血管网络的研究,有助于揭示疾病相关的血管异常。目前该工具已开源,但作为预印本,尚未经过同行评审。