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recount3 Python包:轻松访问RNA-seq数据

新推出的recount3 Python包为Python用户提供了从大型测序仓库中检索和分析统一RNA-seq数据的便捷工具。

recount3在线资源提供了来自Sequence Read Archive等主要测序仓库的数万个统一处理的人类和小鼠RNA-seq样本。传统上,这些数据的访问主要依赖R/Bioconductor生态系统。随着Python在生物信息学和机器学习中的重要性日益增加,开发了recount3 Python包,该包提供了强大的应用程序编程接口和命令行界面,用于发现、下载和具体化recount3资源。该软件协调URL解析和持久化磁盘存储。请注意,该研究为预印本,尚未经过同行评审。

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