bioRxiv preprint Score 75

耐阴野生稻染色体级基因组组装完成

研究团队利用多种测序技术,构建了耐阴野生稻(Oryza granulata)的高质量参考基因组,为水稻遗传改良提供关键资源。

稻属植物包含丰富的遗传多样性,其中野生稻具有许多优良性状。本研究以耐阴野生稻(Oryza granulata)为对象,利用PacBio SMRT、Hi-C和Illumina测序技术,成功构建了染色体级别的参考基因组。最终组装的基因组大小约为764.24 Mb,scaffold N50达59.32 Mb,约96.47%的序列锚定到12条染色体上,BUSCO完整性约98.6%。研究注释了约42,064个蛋白编码基因,其中约95.39%获得了功能注释,并鉴定出约73.46%的重复序列。该基因组资源为水稻耐阴性的遗传机制研究和分子育种提供了重要基础。

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