PeptiDIA：提升快速梯度DIA蛋白质组学肽段鉴定

数据非依赖性采集（DIA）质谱在蛋白质组学中广泛应用，但在快速色谱梯度下分析深度有限。近日，研究人员开发了PeptiDIA框架，通过配对同一样本的快速和长梯度采集数据，利用机器学习提升快速梯度DIA数据中的肽段鉴定能力。该框架处理DIA-NN在宽松假阳性率下的输出，有效弥补通量与深度之间的权衡。研究已在bioRxiv预印本发布，尚未经过同行评审。