AI蛋白质结构预测并非绝对可靠

AlphaFold2等AI蛋白质结构预测工具虽然表现卓越，但其可靠性并非绝对。近日一项预印本研究显示，当输入人工合成的假蛋白质序列时，AlphaFold2仍可能输出高置信度的结构预测，假阳性率约为1/435（基于pLDDT≥70的阈值）。

研究团队利用ColabFold生成了非蛋白质序列，并测试了AlphaFold2对其结构的预测能力。他们发现，即使序列并非真实蛋白质，AI仍有极小概率给出高分结果。这提醒我们，在依赖AI预测进行生物学推断时，需警惕假阳性风险。

此外，研究者还偶然发现某些模型对特定序列存在偏差。该研究尚未经过同行评审，但为AI在结构生物学中的应用敲响了警钟。