WitChi：高效检测系统发育基因组比对中的组成偏差

趋同进化可能导致无关物种的核苷酸或氨基酸组成趋同，这种组成偏差会干扰系统发育推断，尤其在深谱系或采样不均的数据集中。虽然组成感知模型可缓解此问题，但其计算成本高，不适用于大规模分析。WitChi是一种计算高效的工具，通过经验显著性检验识别并去除组成偏差的比对列。它计算特定物种的卡方分数，并与排列派生的零分布比较，从而有效减少偏差。该工具为大型系统发育基因组数据集提供了实用的偏差纠正方案。注意：本文为预印本，尚未经过同行评审。