DyMoTree:树结构神经网络解码细胞命运
新框架利用谱系约束和神经网络,从单细胞转录组中识别早期细胞命运偏差。
一项发表在预印本服务器bioRxiv上的研究介绍了DyMoTree,这是一个新的计算框架,旨在从单细胞RNA测序数据中解码早期细胞命运。该框架将谱系图与树结构神经网络相结合,将细胞命运决定建模为祖细胞与终末细胞状态之间的非线性映射。与现有方法不同,DyMoTree明确利用谱系轨迹约束,提高了推断早期细胞命运偏差的准确性和可解释性。研究团队表示,该方法有助于揭示发育和疾病中的细胞起源和可塑性。需要注意的是,该研究尚未经过同行评审。