MBD2蛋白识别甲基化CpG的双稳态平衡
长达277微秒的分子动力学模拟揭示了MBD2蛋白与甲基化CpG DNA结合时的两种稳定构象,为理解表观遗传调控提供新视角。
甲基-CpG结合结构域2(MBD2)是一种关键的表观遗传调控因子,特异性结合甲基化CpG二核苷酸,控制基因调控和染色质组织。本研究通过总计超过277微秒的经典分子动力学模拟,探索了MBD2-mCpG识别复合物的形成。初始将MBD2定位在目标位点下游一个碱基对处,观察到其在微秒内转移到目标位点。值得注意的是,结合后MBD2呈现两种不同的稳定构象:一种为主要状态。该研究有助于阐明MBD2的高选择性结合机制。需要注意的是,该研究为预印本,尚未经过同行评议。