bioRxiv preprint Score 75

ECMME图谱揭示细胞外基质进化动力学

新创建的ECMME数据库对272种核心基质蛋白进行了跨228种胎盘哺乳动物的逐位点选择压力分析。

细胞外基质(ECM)是多细胞生物的重要创新,提供结构支持和调控信号。然而,其分子层面的进化动力学尚不清晰。近日,研究人员在bioRxiv预印本上发布了ECMME图谱,对272种人类核心基质蛋白进行了逐位点选择压力分析,覆盖多达228种胎盘哺乳动物的直系同源序列。他们开发了自动化流程,整合了直系同源鉴定、密码子比对以及基于HyPhy软件的MEME和FUBAR方法。分析显示,核心结构蛋白受强纯化选择,进化保守,而调控性基质蛋白则呈现更快进化速率,显示出对比鲜明的进化动力学。ECMME资源有助于理解ECM在发育和疾病中的角色。注意:该研究尚未经过同行评审。

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