bioRxiv preprint Score 70

新方法优化单细胞基因表达数据标准化

研究提出PFlogPF标准化方法,满足方差稳定、深度校正和丰度单调性三大要求。

单细胞基因组学分析需要标准化处理,以稳定方差、校正不同细胞测序深度差异,并保留细胞内特征丰度的相对顺序。在一项预印本研究中,研究人员证明PFlogPF方法(包括原始计数上的加法比例拟合、对数变换,再乘法比例拟合)是唯一满足这些要求的特征重标定等变性方法。该方法等价于移位中心对数比变换,在数百个单细胞RNA数据集上的多项基准测试中表现优于现有标准化方法,为单细胞数据质量控制提供了更可靠的方案。这项研究尚未经过同行评审。

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