蛋白质大语言模型助力跨物种单细胞整合

跨物种单细胞转录组整合需要建立基因对应关系。现存方法多依赖Ensembl同源表，其多对多映射常放大基因家族效应，产生虚假微簇。严格的一对一映射虽能减少假象，但损失约900对同源基因。新研究开发基于蛋白质大语言模型（pLLM）的映射策略，在保持一对一映射的同时恢复丢失的基因对，提升了整合质量。