多体原子相互作用图助力结合能预测
新方法通过图神经网络整合成对与三体原子特征,有望加速药物设计进程。
准确预测蛋白质-配体结合亲和力是合理药物设计的关键。传统计算方法依赖复杂评分函数,计算成本高且泛化性有限。本研究提出一种基于图的评分函数,通过构建多层级相互作用图,同时纳入成对和三体原子特征,捕获对结合能预测至关重要的协同空间模式。该方法采用特征融合策略,在多个测试集上展现出优于传统方法的预测性能。研究者表示,该工作为高效、准确的虚拟筛选提供了新思路。本文为预印本,尚未经同行评议。
新方法通过图神经网络整合成对与三体原子特征,有望加速药物设计进程。
准确预测蛋白质-配体结合亲和力是合理药物设计的关键。传统计算方法依赖复杂评分函数,计算成本高且泛化性有限。本研究提出一种基于图的评分函数,通过构建多层级相互作用图,同时纳入成对和三体原子特征,捕获对结合能预测至关重要的协同空间模式。该方法采用特征融合策略,在多个测试集上展现出优于传统方法的预测性能。研究者表示,该工作为高效、准确的虚拟筛选提供了新思路。本文为预印本,尚未经同行评议。