多模态物理证据助力基因调控网络预测

基因调控网络控制细胞命运转变，但现有方法多依赖统计共表达，难以识别非DNA结合基序的调控因子，且泛化能力差。近日，研究人员在bioRxiv发表了一项预印本研究，开发了多模态生物物理框架VitaGRN，通过整合染色质构象、DNA结合信号等物理证据，构建可解释的调控网络，并利用网络传播捕获非经典调控因子。VitaGRN在多个细胞系和扰动因素中表现出色，实现了对未知扰动的精准预测。该研究为理解细胞调控机制和工程化细胞提供了新工具。