双通道网络揭示单细胞基因调控关键因子

基因调控网络由转录因子与其靶基因之间的复杂调控关系构成，理解这些关系对揭示细胞状态转变的分子机制至关重要。单细胞表达数据可揭示细胞类型特异的转录调控，但现有计算方法未能充分利用表达相关性中的共有和特异性信息。近日，研究人员提出一种名为DualGRN的双通道融合图卷积网络，通过同时建模基因表达相关性网络和局部亲和力网络，从单细胞转录组数据中重建基因调控网络并识别关键调控因子。在多种基准数据上，DualGRN在准确率和鲁棒性上均优于现有方法。该研究为单细胞调控分析提供了新工具，但作为预印本尚未经过同行评审。