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反卷积揭示风土影响葡萄花青素的细胞机制

新研究利用SEED算法从批量转录组数据中解析出葡萄浆果中与风土相关的细胞程序,揭示花青素积累的细胞基础。

植物组织由多种细胞类型组成,它们共同决定发育和代谢。单细胞RNA测序虽能解析细胞异质性,但成本高、通量低,难以应用于大规模样本。本研究利用SEED反卷积方法,从已有的批量RNA-seq数据中提取了赤霞珠葡萄浆果的细胞程序。研究发现,特定细胞类型在花青素生物合成中起关键作用,且其活性随风土条件(如土壤、气候)变化,从而影响果实品质。该研究为利用现有转录组数据揭示细胞层面机制提供了新工具,但作为预印本,尚未经过同行评审。

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