机器学习给染色质可及性数据质量打分
新方法通过整合峰信息和背景噪声,为ATAC-seq bigWig轨迹提供质控评分。
染色质可及性实验(如ATAC-seq)产生了大量bigWig格式的信号轨迹,广泛用于可视化和机器学习分析。然而,针对这些轨迹的系统质量控制方法尚不完善。研究人员提出了一种基于生物机制的质控框架,通过整合峰级信息、背景噪声估计和稳定基因组特征恢复,生成质量评分。该框架直接操作于bigWig文件,无需原始数据,有助于筛选高质量轨迹、提高下游分析的稳健性。该研究为预印本,尚未经过同行评审。