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BacteReason:用推理模型预测抗生素耐药性

新模型BacteReason不仅能预测细菌耐药性,还能解释分子机制,有望提升临床决策可信度。

全球抗菌素耐药性(AMR)的迅速蔓延给临床决策带来巨大压力。现有的机器学习预测工具缺乏机制解释,限制了其可信度。近日,研究人员开发了BacteReason——一种推理大语言模型(LLM),可预测细菌对目标抗生素的敏感性,并提供机制性推理。

BacteReason通过对开放权重LLM进行微调获得,训练数据包括临床药敏数据以及由专有教师LLM生成的分子机制解释。这些解释阐明了已知药敏结果背后的生物学机制,使模型具备推理能力。在推理阶段,BacteReason无需调用教师模型,即可独立给出预测和解释。

该模型有望提升抗生素敏感性预测的透明度和临床实用性。目前该研究为预印本,尚未经同行评议。

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