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单细胞多组学揭示肾癌恶性演化机制

整合单细胞多组学,解析透明细胞肾细胞癌分级进展中的表观遗传、代谢与免疫演化,并构建预后模型。

透明细胞肾细胞癌在不同WHO分级间存在显著异质性,但系统性的单细胞多组学研究尚显不足。近日,一项预印本研究整合了多级ccRCC的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,建立了涵盖肿瘤细胞和免疫细胞的多组学框架。

通过伪时间轨迹分析和机器学习集成方法,研究者从转录调控网络的核心节点出发,开发了名为CBG的预后特征。研究发现,肿瘤细胞中表观遗传改变始终先于代谢重编程和侵袭适应,而CD8+ T细胞耗竭也遵循特定的演化轨迹。

这一研究为理解ccRCC恶性进展的分子机制提供了新见解,但作为预印本,其结论尚未经过同行评议。CBG预后模型有望为临床风险分层和治疗策略提供参考。

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