长读长测序揭示奶牛复杂性状调控奥秘
研究利用长读长RNA测序技术,构建了牛的多组学图谱,发现数千个新转录本,为育种提供新靶点。
传统短读长RNA测序难以完全捕捉全长转录本和复杂剪接,导致现有分子图谱存在“调控缺失”问题。近日,研究人员对432头奶牛进行了深度全基因组测序、长读长和短读长RNA测序以及代谢组分析,覆盖四个泌乳阶段。他们扩展了牛转录组图谱,发现13,177个新转录本,并精细定位了超过100万个调控效应。值得注意的是,长读长测序揭示了606个基因存在异构体表达数量性状位点。该研究为理解牛复杂性状的调控机制提供了新视角。需要注意的是,该研究为预印本,尚未经同行评审。