D&D-seq技术:单细胞水平绘制DNA-蛋白互作图谱
利用碱基编辑与纳米抗体融合,新技术在单细胞中记录DNA-蛋白接触,助力基因调控研究。
研究人员开发了一种名为D&D-seq的新方法,利用碱基编辑器和纳米抗体的融合蛋白,在单细胞分辨率下记录DNA与蛋白质的相互作用。该方法能够系统地绘制转录因子和染色质重塑蛋白与DNA的结合位点,为理解基因调控机制提供了前所未有的细节。
D&D-seq技术的核心在于将碱基编辑酶与特异性纳米抗体结合,使得当目标蛋白与DNA结合时,碱基编辑器会在邻近位点引入可检测的碱基变化。这些变化随后通过单细胞测序进行读取,从而推断出每个细胞中的DNA-蛋白质接触图谱。
该技术不仅提高了空间分辨率,还避免了传统方法中需要大量起始材料的限制。研究团队表示,D&D-seq有望应用于发育生物学、肿瘤学和表观遗传学等领域,帮助揭示细胞异质性和疾病相关的基因调控网络。