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Skiver:无参考宏基因组测序质控新工具

利用(k,v)-mer草图,无需参考基因组即可校准测序质量,提升下游分析准确性。

测序数据质量控制是生物信息学流程的关键步骤。现有方法通常依赖比对或质量分数,但参考基因组有时不可用,且未校准的质量分数可能导致偏差。Skiver算法通过(k,v)-mer草图识别一致性特征,评估存活率和风险率,从而无参考地估计错误率并校准Phred分数。该方法适用于宏基因组测序等场景,无需预先比对,降低了计算依赖性。目前该研究以预印本形式发表,尚未经同行评审。

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