SWARM破解RNA修饰信号干扰

纳米孔直接RNA测序理论上可解码表观转录组，检测单个RNA分子上的多个修饰，但高假阳性率阻碍了生物学发现。研究人员开发了SWARM，一种基于AI的框架，其核心创新是串扰感知训练策略，整合非目标修饰和经正交验证的细胞信号，实现对m6A、假尿苷（Ψ）和m5C的单核苷酸和单分子级高精度检测。

在严格的体外和细胞RNA基准测试中，SWARM优于现有工具，并与正交方法保持高度一致。此外，SWARM还揭示了剪接与假尿苷化之间的相互调控关系，为理解RNA修饰的动态调控提供了新视角。

该研究目前以预印本形式发表于bioRxiv，尚未经过同行评审。