表观遗传时钟揭示癌症生存预测新程序
研究发现传统表观遗传时钟在肿瘤中失效,而CpG位点构成的甲基化程序可预测多种癌症的生存期。
一项发表在medRxiv上的预印本研究挑战了表观遗传时钟在癌症中的传统应用。研究人员分析了TCGA九种癌症类型中Horvath时钟CpG位点的甲基化模式,发现肿瘤并未表现出相对于正常组织一致的年龄加速,而是显示出数量级更高的年龄加速方差。此外,标准的时钟汇总指标在生存预测中表现不佳。
研究发现传统表观遗传时钟在肿瘤中失效,而CpG位点构成的甲基化程序可预测多种癌症的生存期。
一项发表在medRxiv上的预印本研究挑战了表观遗传时钟在癌症中的传统应用。研究人员分析了TCGA九种癌症类型中Horvath时钟CpG位点的甲基化模式,发现肿瘤并未表现出相对于正常组织一致的年龄加速,而是显示出数量级更高的年龄加速方差。此外,标准的时钟汇总指标在生存预测中表现不佳。