质谱+纳米孔测序：RNA修饰图谱更准确

RNA修饰在基因调控中至关重要。近日，发表于bioRxiv的一项预印本研究首次系统比较了液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）与纳米孔直接RNA测序（DRS）在绘制RNA修饰图谱中的表现。研究以MS2噬菌体为模型，LC-MS/MS检出13种修饰，而纳米孔DRS仅检出8种，且部分修饰如假尿苷仅在质谱中可见。

研究还发现，牛津纳米孔公司最新推出的RNA004化学试剂和Dorado碱基识别器虽然能识别8种常见RNA修饰，但存在假阳性问题。例如，在检测m6A时，纳米孔DRS可能将其他修饰误判，导致结果偏差。

作者强调，单独依赖纳米孔测序可能产生误导，整合质谱等正交方法是获得可靠RNA修饰谱的关键。该研究尚未经同行评审，但为RNA表观转录组学分析提供了重要参考。