bioRxiv preprint Score 70

无监督框架UMITIC解析多重成像数据

新框架无需标注即可联合分析细胞表型和空间邻域,适用于超多重成像数据。

多重成像技术能同时测量数十种蛋白标志物并保留组织结构,但提取有意义的信息仍是挑战,尤其是超多重(>20标记)无标注数据。近日,研究人员开发了UMITIC(无监督多重图像组织特征分析)框架,用于从多重成像数据中联合表征细胞表型和组织邻域。该框架包含三个模块:CellC(细胞聚类)、NeighborhoodC(邻域聚类)和SpatialC(空间特征)。在模拟数据集和真实肺癌样本中,UMITIC成功识别了已知细胞类型和空间组织模式,并发现了与免疫浸润相关的独特邻域特征。该研究以预印本形式发布,尚未经过同行评审。

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