混合测序精准重建土壤微生物基因组
结合短读与HiFi长读长测序,大幅提升复杂土壤宏基因组组装基因组的完整性与分辨率。
一项预印本研究评估了结合短读(SR)与HiFi长读长(HiFi-LR)测序在复杂土壤微生物组中重建宏基因组组装基因组(MAGs)的效果。结果显示,混合测序策略显著提高了基因组的完整性和连续性,同时提升了分类和功能注释的分辨率。
HiFi-LR测序虽然能改善组装质量,但成本较高且通量较低,导致在分箱阶段覆盖深度不足,限制基因组恢复。通过结合SR数据,可以弥补这一缺陷,实现更全面的基因组重建。
研究者指出,该策略为深入挖掘土壤微生物暗物质提供了有力工具,但该结果尚未经过同行评审,需进一步验证。