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肝细胞癌跨病因转录组保守性揭示增殖与肝细胞缺失程序

研究发现不同病因的肝癌共享保守的转录组变化,基于增殖和肝细胞缺失模块的评分系统可稳健区分肿瘤与正常组织。

肝细胞癌(HCC)的病因包括乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染,但其转录组变化是否具有跨病因保守性尚不清楚。近日一项预印本研究分析了HBV和HCV相关HCC的发现队列,通过Hallmark GSVA和差异表达分析,鉴定出保守的肿瘤上调基因(ProlifHub模块)和下调基因(HepLoss模块),并构建了HCCState评分(ProlifHub评分减去HepLoss评分)。该评分在多个独立GEO队列及TCGA-LIHC数据集中得到验证,稳健区分肿瘤与正常组织,且模块大小定义不影响其性能。研究提示,不同病因驱动的HCC共享关键的增殖和肝细胞丢失转录程序,为精准分层提供了新工具。需注意该研究尚未经同行评审。

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