bioRxiv preprint Score 70

Vi-TIS:精准区分活/死突变体的测序新方法

改良转座子插入测序技术,结合PMA处理消除生长偏倚,提升细菌基因功能研究准确性。

转座子插入测序(TIS)是评估细菌基因必需性的高通量技术,但传统方法依赖菌株复制富集,导致慢生长或非复制突变体被误判。新研究Vi-TIS引入PMA处理,利用其膜通透性差异选择性去除死细胞DNA,仅测序活菌突变体。实验显示,Vi-TIS在铜绿假单胞菌中鉴定出的必需基因集更接近真实情况,且对生长缺陷突变体的检测灵敏度显著提高。该方法无需改变基础流程即可拓展至其他细菌,为病原菌功能基因组学提供更精准工具。需注意该研究尚未经过同行评审。

bacterial geneticstransposon sequencinggene essentiality