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CMAPS:解析基因调控的因果中介新工具

新框架CMAPS利用因果中介分析,从大规模扰动筛选数据中揭示基因调控的分子中介。

结合CRISPR-Cas9扰动筛选与单细胞多组学技术,研究人员可以深入剖析基因调控机制。然而,现有分析方法主要量化总扰动效应,未能揭示传递这些效应的分子中介。近日,研究人员开发了CMAPS(Causal Mediation Analysis for Perturbation Screens),这是一个半参数框架,能够稳健地进行中介分析,处理未测量的中介-结果混淆因素,并结合自适应自举检验控制错误发现率。模拟和计算实验表明,CMAPS能提供准确、校准的中介估计,并稳健地识别中介因子。该工具为解析基因调控网络中的中介机制提供了新方法。注意:该预印本尚未经过同行评审。

CRISPRgene regulationcausal inferencesingle-cell genomics