PerturbPlan：设计Perturb-seq实验的分析框架

PerturbPlan是一个用于设计Perturb-seq实验的分析框架。Perturb-seq结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序，能高效解析非编码元件和基因功能。然而，此类实验涉及大量设计参数，平衡统计功效与成本十分困难。现有唯一的模拟方法计算成本高，需高性能计算。PerturbPlan推导出一种新的解析公式，可快速评估检测扰动-表达关联的功效，运行时间仅为模拟方法的千万分之一。该加速使在标准台式电脑上就能快速优化实验设计。该研究以预印本形式发布，尚未经过同行评审。