磷酸蛋白质组学新算法揭示EGFR信号通路重编程

一项发表于bioRxiv的预印本研究报道了一种新的计算框架，利用时间分辨磷酸蛋白质组学数据重建细胞类型特异性信号通路。该算法结合广度优先搜索（BFS）和基于STRING蛋白互作数据库的交互权重引导波束搜索，从24个时间点的磷酸化数据中识别EGFR信号动态。分析显示，SHP2抑制剂在不同细胞系中诱导了不同的磷酸化模式和信号途径重编程，提示其可能导致适应性耐药。该框架为量化药物诱导的途径变化和克服靶向治疗耐药性提供了新思路。注意：本研究尚未经过同行评审。