DAMPA：加速靶向宏基因组探针设计

靶向宏基因组学通过寡核苷酸探针富集样本中多种微生物，已成为病毒和复杂多微生物样本基因组学的标准方法。高效富集需要探针能捕获保守和高度多样区域，但现有计算方法在处理大量基因组时扩展性差，多样序列常被低估。

近日，研究人员开发了DAMPA（Design of Accelerated and simplified probe panels for targeted metagenomics using pangenome graphs），利用泛基因组图加速并简化探针面板设计。该工具通过图形结构减少冗余，提高多样序列的覆盖率，并确保探针均匀性。

测试表明，DAMPA在处理大规模基因组集合时效率显著提升，且能设计出更优的探针集。这是预印本研究，尚未经过同行评审。