文库制备策略显著影响RNA病毒检测灵敏度
研究发现,SISPA技术通过PCR抑制效应优先扩增病毒片段,有望提升临床宏基因组学中RNA病毒的检出率。
临床宏基因组学利用测序技术直接从临床样本中识别病原体,无需培养。然而,RNA病毒检测需额外步骤(如逆转录),灵敏度通常低于细菌或真菌。一项新研究揭示了序列非依赖单引物扩增(SISPA)的机制:该技术通过利用PCR抑制效应,优先扩增较长的病毒cDNA片段,从而显著提升RNA病毒检出灵敏度。该发现为优化病原体检测方案提供了重要理论基础。
研究发现,SISPA技术通过PCR抑制效应优先扩增病毒片段,有望提升临床宏基因组学中RNA病毒的检出率。
临床宏基因组学利用测序技术直接从临床样本中识别病原体,无需培养。然而,RNA病毒检测需额外步骤(如逆转录),灵敏度通常低于细菌或真菌。一项新研究揭示了序列非依赖单引物扩增(SISPA)的机制:该技术通过利用PCR抑制效应,优先扩增较长的病毒cDNA片段,从而显著提升RNA病毒检出灵敏度。该发现为优化病原体检测方案提供了重要理论基础。