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纳米古菌门基因组大幅扩充,揭示关键基因水平转移

利用纳米孔测序技术,科学家从海洋和地下水环境中捕获了208个完整的纳米古菌基因组,为理解这类微小古菌的进化提供了新视角。

纳米古菌门是一类体型微小的古菌,此前仅有4个完整基因组可供研究。最新研究中,科学家利用牛津纳米孔测序技术,从波罗的海海水和芬诺斯坎迪亚地下水(地下69-201米)的宏基因组中,成功组装了208个完整的纳米古菌基因组,使该门的完整基因组数量增加了52倍。系统发育分析涵盖了1239个分类单元,支持了GTDB数据库中纳米古菌门各目的单系性,包括在环境样本中占优势的Woesearchaeales、Pacearchaeales和SCGC-AAA011-G17。此外,研究还发现了Form III RuBisCO基因在古菌和帕特斯菌门之间的频繁水平转移,暗示该光合作用关键酶可能在古菌进化中发挥了意外作用。该研究为理解纳米古菌的生态和进化提供了重要数据基础。

archaeagenomicshorizontal gene transfer