bioRxiv preprint Score 75

ESM3高效设计结蛋白,成功率89%

多模态语言模型ESM3在结蛋白设计中展现卓越能力,成功率远超传统方法,拓扑鲁棒性惊人。

多模态蛋白质语言模型在蛋白质设计领域展现出巨大潜力,但其对复杂拓扑特征的捕捉能力尚不清晰。近日,研究者以结蛋白为测试案例,利用ESM3模型进行引导生成,成功率达89%(95% CI: 81-94%),而传统未引导的扩散方法成功率仅约0.5%。研究还发现,结拓扑结构对序列扰动具有惊人鲁棒性:平均需要改变84%的蛋白质序列才能破坏结结构,且破坏过程呈现明显的阈值效应。这些发现为设计具有特定拓扑特性的蛋白质提供了新思路。需注意该研究为预印本,未经同行评审。

protein designAIstructural biology