速率变异驱动假杂交信号

系统发育网络推断方法被广泛用于从基因组数据中检测杂交和基因流，但其对常见模型违反的稳健性尚不明确。一项发表于bioRxiv的预印本研究通过模拟评估了隐性旁系同源和替换速率变异对两种常用网络推断方法（ADMIXTOOLS 2的find_graphs和SNaQ）的影响。利用从爬行动物系统发育校准的八物种树，研究者模拟了不同水平的隐性旁系同源和速率变异。结果显示，隐性旁系同源对网络推断影响有限，而速率变异（尤其是谱系特异性速率）显著导致假阳性杂交信号的增加。研究强调，在实际数据分析中应谨慎解释网络结果，并考虑速率异质性的影响。该研究尚未经过同行评审。