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ACT流程:长读长扩增子分类新工具

ACT整合三个分类管道,提升ONT长读长扩增子的微生物群落分类准确性。

表征微生物群落组成是理解其功能的基础。牛津纳米孔技术(ONT)的长读长测序现允许使用全长基因扩增子进行群落分析,其分类分辨率优于标准短扩增子Illumina测序。然而,缺乏稳健的ONT兼容分析流程。为此,研究者创建了扩增子共识分类(ACT)流程,用于对长读长扩增子进行分类。ACT整合了三个现有管道(Emu、Sintax和LACA)的输出,以利用各自的优势并弥补其局限性。同时,开发者还建立了ACT数据库以支持该流程。该研究为预印本,尚未经过同行评审。

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