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从RNA序列预测细胞活性

新研究建立热力学模型,通过序列改变预测RNA功能与蛋白结合。

来自Cell Press的最新研究开发了一种热力学框架,能够从RNA序列预测其细胞活性。研究团队以HIV-1的TAR RNA为模型,通过系统性突变改变序列,使其功能二级结构的倾向性发生高达500倍的变化。利用1H CEST NMR技术测量结构倾向,研究者发现这些微小序列变化可以定量预测蛋白质结合亲和力和细胞反式激活活性。该框架基于二级结构预测算法,为RNA功能设计提供了新工具。

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