空间查询：发现多细胞空间模式

空间分辨单细胞技术可原位分析细胞，但联合发现多细胞空间模式并描述其分子程序的计算方法仍然有限。针对这一挑战，研究人员开发了SpatialQuery框架。该框架不仅能识别细胞基序，即重复出现的多细胞共定位模式，还能对这些模式进行深度分子分析。

SpatialQuery通过差异表达分析揭示受空间背景调控的基因，并利用协变分析检测基因的协调表达变化。它能够识别功能性组织单元，并超越传统的配对分析方法，全面描绘多细胞相互作用图景。

该工具为理解组织微环境中的细胞功能与空间组织之间的关系提供了关键支持，有助于揭示复杂生物系统中细胞通信的分子基础。研究成果表明，SpatialQuery在解剖组织结构和疾病机制研究中具有广泛应用前景。